자율전공학부에 소속된 학생은 졸업 시, 최종적으로 선택한 전공에 따라 졸업장이 발급됩니다. 즉, 졸업장에는 학생이 자율전공학부를 통해 여러 전공을 탐색한 후, 그 중에서 최종적으로 결정한 전공이 표기됩니다. 예를 들어, 자율전공학부에서 다양한 전공을 고려하고, 그 후 경영학과를 최종적으로 전공으로 선택했다면, 졸업장에는 "경영학 전공"이라고 명시됩니다. 이는 자율전공학부 학생이 전공을 자유롭게 선택할 수 있는 특성을 반영하는 것으로, 학생의 전공 선택에 대한 공식적인 기록을 졸업장에 반영하는 방식입니다. 따라서, 졸업장이 표기하는 전공은 학생이 학습한 분야와 그에 대한 공식적인 이수를 나타내며, 이는 향후 학문적 및 직업적 경로에서 중요한 역할을 하게 됩니다.